Studienprojekte
D-Light on Promoters
Studienprojekt (Bioinformatik), 01.10.2010 - 30.06.2011, Partner: Abteilung für Molekularbiologie, Universität Salzburg, Salzburg
Ziel
Transkriptionsfaktoren spielen eine gewichtige Rolle bei der Regulierung unserer Gene. Der Nachweis von Transkriptionsfaktorbindestellen im Labor ist zeitaufwendig und kostspielig. Dementsprechend gefragt sind Vorhersageprogramme und geeignete Darstellungsmöglichkeiten. In Kooperation mit der Universität Salzburg wird im Rahmen des Projekts eine Server-Client Lösung erstellt, welche Transkriptionsfaktorbindestellen vorhersagt (Server) und diese in einem intuitiven Viewer (Client) darstellt. Sowohl bei der Kommunikation zwischen Server und Viewer als auch bei der Darstellung wird dabei auf Standards und erprobte Bibliotheken zurückgegriffen. Dies soll eine Wiederverwendung möglichst vieler Programmbestandteile für ähnliche Problemstellungen ermöglichen.