Campus HagenbergInformatik, Kommunikation, Medien

Studienprojekte

3D Modeling Pipeline

Zeitraum
Mar 2020 - Jan 2021
FH Studierende
Studiengruppe Bioinformatik
FH BetreuerIn
Josef Laimer
Themenfelder
Bioinformatik
FirmaFirmen Coach
Peter Lackner

Proteine sind in den meisten biologischen Prozessen involviert und Wissen über deren 3D Struktur ist häufig der Schlüssel zum Verständnis ihrer Funktion. Trotz der stetig steigenden Anzahl an experimentell aufgeklärten Strukturen, sind gegenwärtig die meisten Proteine noch nicht strukturell aufgeklärt. Dazu kommt eine große Menge an Proteinvarianten, die nur im geringen Umfang berücksichtigt werden.

Um bei diesen Proteinen dennoch strukturbasierte Analysen zu ermöglichen, wurden eine Reihe von Methoden zur Modellierung von 3D Proteinstrukturen entwickelt. Die Auswahl der Methode beziehungsweise die Kombination unterschiedlicher Verfahren kann dabei die Qualität der Modelle deutlich beeinflussen. In diesem Projekt wird für diesen Zweck eine einfach zu bedienende Pipeline entwickelt, welche auf Basis einer gegebenen Proteinsequenz geeignete Methoden auswählt beziehungsweise kombiniert und die resultierenden Modelle bewertet.