Campus HagenbergInformatik, Kommunikation, Medien

Studienprojekte

Oligo-Definition of Genuine PCR Primer Sets

Zeitraum
Mar 2016 - Jan 2017
FH Studierende
Studierendengruppe MBI
FH BetreuerIn
FH-Prof. Dr. Stephan Winkler; Viktoria Dorfer, MSc
Themenfelder
Bioinformatik
Firma
Labor für Tropenveterinärmedizin, VetMedUni Wien
Firmen Coach
Mag. Georg Mair


Dieses Programm soll für gegebene Sequenzen in Abhängigkeit von mehreren Design-Parametern möglichst optimal passende Primern und Sonden (Oligo-Sequenzen, OS) generieren. Diese OS sollen automatisiert über das Web-API von BLAST überprüft werden, um herauszufinden, welche der gefundenen Oligo-Sequenzen an das gegebene Target binden.In diesem Projekt soll ein Programm für das Design und die Verwaltung von Primern und farbstoffmarkierten Sonden für PCR und qPCR entworfen und implementiert werden.